Bueno, de "oh maestros" poco, sino estaríamos tumbados en un yate en las Seychelles con un Mojito en la mano o algo así, xD

En Unity3D no se programa ni con C ni con Java, sino con C# y con Javascript, y ambos son igualmente válidos, quizá para empezar pueda resultar más fácil o cercano Javascript, pero porque es más flexible. Yo por ejemplo utilizo los 2 según me dé, por ejemplo para cosas más complejas hago con C#, pero vamos, que no hay una elección mejor que la otra (creo yo)